傳統(tǒng)的水產(chǎn)養(yǎng)殖，隨著魚的排泄物積累，水體的氨氮增加，毒性逐步增大，因此需要及時(shí)換水。而在魚菜共生系統(tǒng)中，水產(chǎn)養(yǎng)殖的水被輸送到水培栽培系統(tǒng)，由細(xì)菌將水中的氨氮分解成亞硝酸鹽然后被硝化細(xì)菌分解成硝酸鹽，硝酸鹽可以直接被植物作為營養(yǎng)吸收利用。
魚菜共生最有吸引力的地方有三點(diǎn)：
第一，種植方式、全流程自證清白。因?yàn)轸~菜共生系統(tǒng)中有魚存在，任何農(nóng)藥都不能使用，稍有不慎會(huì)造成魚和有益微生物種群的死亡和系統(tǒng)的崩潰。
第二，魚菜共生系統(tǒng)脫離土壤栽培，避免了土壤的重金屬污染，因此魚菜共生系統(tǒng)蔬菜和水產(chǎn)品的重金屬殘留都遠(yuǎn)低于傳統(tǒng)土壤栽培。
第三，魚菜共生系統(tǒng)蔬菜有特有的水生根系，如果魚菜共生農(nóng)場(chǎng)帶著根配送的話，消費(fèi)者很容易識(shí)別蔬菜的來源，避免消費(fèi)者產(chǎn)生這顆蔬菜是不是來自批發(fā)市場(chǎng)的疑慮。
魚菜共生系統(tǒng)中，魚并不單純是養(yǎng)魚，蝦、蟹、貝之類的水產(chǎn)品也可以養(yǎng)殖。菜的種植是起到凈化養(yǎng)殖水的目的，并可以附帶一些蔬菜生產(chǎn)帶來的經(jīng)濟(jì)效益。農(nóng)作物方面，生菜、油菜、香菜、蔥、姜、蒜、西紅柿、黃瓜、茄子等葉菜和果菜都可以種植，并有不錯(cuò)的產(chǎn)量。
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